Опция "Наложение узора" предполагает именно наложение, то есть, размещение слоя с узором поверх исходного. И как бы ни выглядел исходный слой, при режиме наложения узора "нормальный" он будет полностью скрыт под слоем узора.
В данном случае, поскольку исходный слой(лист бумаги)достаточно светлый, можно изменить режим наложения для узора на умножение или затемнение основы.
Альтернативный вариант - создать новый слой поверх исходного и рисовать на нем.

Но очень красиво. Это напоминает уже не стекло, а драгоценный камень.